A cirurgia bariátrica é uma cirurgia do aparelho digestivo e assim como todas as outras é passível de complicações. Segundo vários estudos recentes, estas complicações não são mais frequentes, nem mais graves que as cirurgias semelhantes como: para colecistite aguda, apendicite aguda, cirurgias ginecológicas, outras cirurgias do estômago e do cólon.  A mortalidade é realmente muito baixa, em torno de 0,4% na estatística geral, podendo ser ainda muito menor em alguns grupos. Uma equipe multidisciplinar especializada e com experiência e um paciente consciente de suas responsabilidades, pode ter excelentes resultados com a mortalidade se aproximando a ZERO.